水污染防治法修正案草案12月20日首次提請十二屆全國人大常委會第二十五次會議審議。受國務院委托，環境保護部部長陳吉寧作了草案說明。陳吉寧表示，“十二五”期間，我國化學需氧量減排12.9%，氨氮減排13%，超額完成減排任務。

現行水污染防治法是1984年制定的，先后于1996年和2008年兩次修訂，對防治水污染發揮了重要作用。此次修正案草案全面落實了《水污染防治行動計劃》(以下簡稱“水十條”)確定的主要制度措施，并與新修訂的環保法相銜接，圍繞全國人大常委會執法檢查發現的重點問題和社會普遍關注的突出問題，作出了多項修改。

草案進一步強化了地方政府責任，明確企業主體責任，完善總量控制與排污許可、飲用水安全保障、地下水污染防治與水生態保護、區域流域水污染聯合防治等制度，加大處罰力度，將確定的各項制度措施法制化、規范化。

草案強化了地方政府責任，規定未達到水污染防治規劃確定的水環境質量改善目標的，有關市、縣級人民政府應當制定限期達標規劃，明確防治措施及達標時限，并可以根據達標需要對本行政區域內的水污染物排放單位提出嚴于國家和地方水污染物排放標準的控制要求。同時明確，有關市、縣級人民政府應當將限期達標規劃報上一級人民政府備案，并向社會公開。

根據環境保護法立法精神，草案進一步嚴格了法律責任，對無證或者不按證、超標、超總量排放水污染物等違法行為，規定由縣級以上人民政府環境保護主管部門責令改正或責令限制生產、停產整頓，并處十萬元以上一百萬元以下的罰款;情節嚴重的，報經有批準權的人民政府批準，責令停業、關閉。此外，草案還與環境保護法規定的按日連續處罰和拘留措施進行了銜接。